O Acervo Digital (AD) engloba todo o material musealizado e tratado pelo Programa de Produção, Preservação e Difusão Histórica (PPPDH) e é composto por 4 acervos – Acervos de Pesquisa, Acervos Transcestrais, Arquivo Vivo e Acervos MUTHANTES. Esses 4 acervos podem ser acessados pelo repositório digital Tainacan, um plugin de código aberto para WordPress que ficará dentro do website do MUTHA. A escolha do Tainacan é justificada pelo seu mecanismo de busca comum, em que diversos metadados sobre o objeto musealizado como data, região, idade, raça-etnia, campo do conhecimento, dentre outras, podem ser encontrados.